Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM27Q9HBJ8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM27Q9HBJ8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms