Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBF4

ZFYVE1, Zinc finger FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE1Q9HBF4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZFYVE1Q9HBF4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFYVE1Q9HBF4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFYVE1Q9HBF4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFYVE1Q9HBF4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFYVE1Q9HBF4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZFYVE1Q9HBF4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFYVE1Q9HBF4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFYVE1Q9HBF4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFYVE1Q9HBF4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFYVE1Q9HBF4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZFYVE1Q9HBF4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZFYVE1Q9HBF4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE1Q9HBF4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE1Q9HBF4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms