Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELL3Q9HB65 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms