Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPCSQ9HAB8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms