Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVMER34-1Q9H9K5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVMER34-1Q9H9K5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVMER34-1Q9H9K5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVMER34-1Q9H9K5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms