Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C5orf42Q9H799 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf42Q9H799 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf42Q9H799 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C5orf42Q9H799 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms