Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM38AQ9H6F2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM38AQ9H6F2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms