Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOJQ9H4E5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOJQ9H4E5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOJQ9H4E5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms