Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRN3Q9H3W5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3Q9H3W5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms