Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTIF3Q9H2K0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTIF3Q9H2K0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTIF3Q9H2K0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTIF3Q9H2K0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms