Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDEL1Q9GZM8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDEL1Q9GZM8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NDEL1Q9GZM8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NDEL1Q9GZM8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDEL1Q9GZM8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDEL1Q9GZM8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDEL1Q9GZM8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDEL1Q9GZM8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDEL1Q9GZM8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDEL1Q9GZM8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms