Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP44Q9C0F1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP44Q9C0F1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms