Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2OQ9C0C9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2OQ9C0C9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE2OQ9C0C9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms