Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT23Q9C075 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KRT23Q9C075 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT23Q9C075 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT23Q9C075 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT23Q9C075 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT23Q9C075 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT23Q9C075 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT23Q9C075 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT23Q9C075 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT23Q9C075 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT23Q9C075 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT23Q9C075 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT23Q9C075 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT23Q9C075 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT23Q9C075 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT23Q9C075 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KRT23Q9C075 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT23Q9C075 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT23Q9C075 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT23Q9C075 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT23Q9C075 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT23Q9C075 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT23Q9C075 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT23Q9C075 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT23Q9C075 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT23Q9C075 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT23Q9C075 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT23Q9C075 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT23Q9C075 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT23Q9C075 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT23Q9C075 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT23Q9C075 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT23Q9C075 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT23Q9C075 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT23Q9C075 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT23Q9C075 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT23Q9C075 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT23Q9C075 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT23Q9C075 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT23Q9C075 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT23Q9C075 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT23Q9C075 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KRT23Q9C075 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT23Q9C075 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT23Q9C075 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT23Q9C075 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT23Q9C075 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT23Q9C075 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT23Q9C075 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms