Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM6Q9C030 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM6Q9C030 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM6Q9C030 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM6Q9C030 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM6Q9C030 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM6Q9C030 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM6Q9C030 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM6Q9C030 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms