Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXP3Q9BZS1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms