Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF1Q9BYJ9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms