Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRIP1Q9BX63 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRIP1Q9BX63 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms