Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HIRIP3Q9BW71 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HIRIP3Q9BW71 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HIRIP3Q9BW71 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms