Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KATNB1Q9BVA0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KATNB1Q9BVA0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms