Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCMBPQ9BTE3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCMBPQ9BTE3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCMBPQ9BTE3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCMBPQ9BTE3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms