Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UPK3BQ9BT76 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPK3BQ9BT76 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms