Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNPY3Q9BT09 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNPY3Q9BT09 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNPY3Q9BT09 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNPY3Q9BT09 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNPY3Q9BT09 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNPY3Q9BT09 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNPY3Q9BT09 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNPY3Q9BT09 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNPY3Q9BT09 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNPY3Q9BT09 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNPY3Q9BT09 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms