Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC39A3Q9BRY0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A3Q9BRY0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms