Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SDF4Q9BRK5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDF4Q9BRK5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDF4Q9BRK5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms