Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC17Q9BRA2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TXNDC17Q9BRA2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms