Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHOXF2Q9BQY4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOXF2Q9BQY4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms