Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMIM7Q9BQ49 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM7Q9BQ49 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms