Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX50Q9BQ39 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms