Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSG101Q99816 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSG101Q99816 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms