Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPEPQ99797 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 254.3 ms