Protein–RNA interactions for Protein: Q99788

CMKLR1, Chemokine-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMKLR1Q99788 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMKLR1Q99788 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMKLR1Q99788 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CMKLR1Q99788 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMKLR1Q99788 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMKLR1Q99788 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMKLR1Q99788 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMKLR1Q99788 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMKLR1Q99788 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMKLR1Q99788 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMKLR1Q99788 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMKLR1Q99788 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMKLR1Q99788 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMKLR1Q99788 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMKLR1Q99788 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMKLR1Q99788 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CMKLR1Q99788 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms