Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MEIS3Q99687 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MEIS3Q99687 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MEIS3Q99687 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MEIS3Q99687 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms