Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPF18Q99633 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF18Q99633 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF18Q99633 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms