Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLF6Q99612 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLF6Q99612 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLF6Q99612 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms