Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAT1Q99536 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VAT1Q99536 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAT1Q99536 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms