Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOTCH4Q99466 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOTCH4Q99466 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NOTCH4Q99466 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms