Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSRNP1Q96S65 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSRNP1Q96S65 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms