Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF13CQ96RJ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms