Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZIM3Q96PE6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIM3Q96PE6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms