Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLRP3Q96P20 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NLRP3Q96P20 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms