Protein–RNA interactions for Protein: Q96NI6

LRFN5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN5Q96NI6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LRFN5Q96NI6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN5Q96NI6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRFN5Q96NI6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRFN5Q96NI6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRFN5Q96NI6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN5Q96NI6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN5Q96NI6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN5Q96NI6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN5Q96NI6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN5Q96NI6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN5Q96NI6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN5Q96NI6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms