Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP57Q96MR6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms