Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCMTD1Q96MG8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCMTD1Q96MG8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms