Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHL15Q96M94 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHL15Q96M94 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL15Q96M94 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL15Q96M94 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL15Q96M94 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL15Q96M94 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms