Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPD52L3Q96J77 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TPD52L3Q96J77 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPD52L3Q96J77 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms