Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCMH1Q96GD3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCMH1Q96GD3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCMH1Q96GD3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms