Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT43Q96FT9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT43Q96FT9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT43Q96FT9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms