Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CPNE2Q96FN4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms