Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDC3Q96F86 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDC3Q96F86 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms